中央厨房冷链系统的工艺流程设计，主要包含动线的规划与温区的设置。其中，中央厨房动线的规划，相比冷链物流中心的动线规划更加复杂，主要包括人流、物流、气流，以及废弃物、容器输送与回收等的动线。货物与人员的流动，不能阻断、迂回、绕行和相互干扰，动线要合理流畅。
       人流动线一般包括生产人员更衣消杀、由人员入口进入各个生产车间，低洁净区人员不能进入高洁净区，生产人员中途休息后需重新更衣消杀。
物流动线通常有原材料输送、配料输送、不同工序生产加工、生产完成后称重包装打包等环节。
       气流主要有各个车间的气流组织，气流组织需要确定各生产区、功能区的正负压，基本原则是高清净、干燥防潮的环境需要保持正状态，使室内空气向外流动，使油烟、蒸汽不能进入室内污染环境和食品，产生油烟、蒸汽、异味、潮湿、余热的环境要保持负压状态，使室外气流向内流动，实施气流流程控制。
       废弃物流主要是生产过程中产生的固体废弃物，如菜叶根皮、纸箱塑料泡沫等包装物等，废弃物就地收集，就近通过专用通道转移至厂房外部。

       在当前预制菜迅猛发展的机遇下，中央厨房及相关冷链系统的建设再度成为冷链行业关心的问题。如何规划建设好中央厨房的冷链系统，需要从产品特性、工艺流程、运营模式、园区建筑、投入产出等多方面进行专业研究，互相均衡，才能尽量为中央厨房的顺利投产和运行提供保障。